Hall JanR,
Schau mal hier.
Da wurde in etwa die gleiche Frage gestellt und beantwortet.
Stackoverflow How to automate Keystore generation using the java keystore tool? w/o user interaction
Kommst du damit zurecht?
Ergänzend auch hier:
Specify the keystore password using the -storepass option:
Code
keytool <commands and options> -storepass changeit